Ils vont travailler ensemble ou chacun de leur côté ?
Normalement, l'AG désigne un (et un seul) commissaire aux comptes.

A Grmf! et Panchito avec leur discussion sur le taux de xx% à appliquer au loyer privé pour compenser l'impôt supplémentaire

Un état des lieux 16 ans après l'entrée dans les lieux ?  à quoi ça sert ?  tout est amorti...

Pour les garanties locatives, si les documents ne sont pas signés avant le décès d'une des parties, ça risque d'être la galère....
Mais rien d'impossible puisque vous pourrez reconstitué les faits : la vente, la demande de transfert de l'ancien propriétaire vers le nouveau, le locataire avec son bail et, enfin, le décès.... Il faudra juste trouver l'employé bancaire de bonne volonté pour faire toutes les démarches....

Le mot "entreprise" prête à confusion : un indépendant est une entreprise mais une entreprise ça peut aussi être une société (SPRL par exemple)...
Si indépendant = entreprise : il n'est effectivement pas possible de faire une sous-location partielle à son activité d'indépendant. C'est donc le bail d'habitation qui reste d'application et déduire une partie du loyer payé au propriétaire pourrait entrainer de gros problèmes et litiges avec le propriétaire. C'est généralement interdit dans le bail sans l'accord du propriétaire....

Si entreprise = société : la sous-location partielle du locataire à sa société est tout à fait possible (avec l'accord du propriétaire) et très intéressant pour le locataire sans que cela ne coûte un € au propriétaire. C'est une option qui doit, TOUJOURS, être envisagée quand on fixe le siège de sa société à son domicile privé.
Et ce n'est pas que financier. Par exemple : sous-louer avec un bail un bureau précis dans une maison permet de limiter l'accès d'un contrôleur ou un huissier à ce seul bureau plutôt qu'à toute la maison s'il n'y a pas de bail pour la société... A recommander !

Indépendant ou entreprise ?
Si indépendant : il n'y a rien à faire. Vous êtes enregistré comme indépendant à votre domicile et cela n'a aucune influence sur votre bail d'habitation. A condition de ne pas déduire de loyer (ni charges d'occupation comme p.e. 15% des notes d'électricité, eau, chauffage sauf si compteurs séparés)  dans vos charges professionnelles.
Si société : cela devient de la sous-location partielle. Votre bail l'interdit probablement sans l'accord du bailleur. Il faut donc obtenir son accord ! Si c'est bien fait et raisonnable, cela ne coûtera rien de plus au propriétaire.

Voyez votre comptable...

Si c'est la seule motivation, ce sera rarement intéressant (les loyers privés seront aussi imposés et les revenus "coincés" dans la société).

Par contre, s'il y a beaucoup de travaux à faire dans l'immeuble, ça mérite réflexions et analyses.

Si le vendeur et vous êtes d'accord sur la méthode de répartition, faites les calculs et soumettez les directement au vendeur.
Une fois d'accord, vous envoyez la répartition au syndic et chacun paie sa part (vous, le fonds de roulement également).

Le syndic "s'en moque" de savoir qui paie. Ce qui compte pour lui est d'avoir récupérer le montant dû par l'appartement et le fonds de roulement du nouveau pour pouvoir rembourser le vendeur.
Le syndic est régulièrement entre deux chaises lors d'une répartition suite vente car, justement, les parties n'ont pas compris ce qui se trouvaient dans l'acte jusqu'au moment où ils reçoivent la note à payer....
Le syndic veut que l'ACP soit remboursée de ce qui lui revient.... qui paie est sans importance  !

C'est l'exagération habituelle de Panchito.... un juge vous dirait que vous ne pouvez pas vous faire justice mais dirait aussi à votre proprio qu'il ne peut retenir les fonds dus... chacun repartirait avec sa petite tape sur les doigts, sans plus.

Vous écrivez à votre prop. pour lui demander le remboursement avant le 20.04 et lui annoncez que si ce n'est pas fait vous ferez une compensation avec le loyer de mai.
Ce n'est pas légalement permis mais ne pas vous rembourser votre crédit ne l'est pas plus.... 1€ contre 1€....

Bien entendu, il faut que votre crédit de charges soit avéré !

Faux. Dans (presque) tous les cas, quand on est marié ou cohabitants légaux il n'y a qu'un seul AER reprenant tous les revenus du couple.

Exceptions auxquels je pense et les plus classiques : l'année du mariage et fonctionnaire international pour un des époux